En sus primeras misiones, el USS Voyager busca una nave de los Maquis, un grupo de liberadores de la región exterior de la Federación que ha desaparecido en Badlands, una zona muy poco conocida de la Vía Láctea. El Voyager acaba encontrando la nave Maquis en las profundidades más lejanas de la galaxia, el cuadrante Delta. Es una zona tan lejana, que el viaje de vuelta durará 75 años. Con el fin de proteger al Voyager, la nave Maquis se sacrifica en una batalla contra Kazon. La tripulación pasa a Voyager antes de que su nave explote y las dos tripulaciones, muy diferentes, deben iniciar juntas el regreso a la Federación.
El USS Voyager, con número NCC-74656, es una de las primeras naves de la clase Intrépido y, por lo tanto, se encuentra entre las naves más modernas de toda la flota. Cuanta con todos los avances tecnológicos y, al ser de la clase Intrépido, está diseñada para explorar el espacio y dispone del sistema de dirección Warp, que no sufre los fallos que tenían los sistemas anteriores. La velocidad máxima es de 9,9 Warp constantes. El Voyager tiene una tripulación formada por 150 efectivos, una longitud de 344m y pesa casi 750.000t. El fuselaje es de una aleación de titanio duranio. Esta nave se construyó en la estación terrestre de McKinley en el año 48038, que corresponde al año terrestre 2371. Como en todas las naves de la flota, el puente de control es el punto neurálgico. En el centro de mando, situado en el medio del puente, se encuentran los monitores y los asientos del capitán y el primer oficial. Las partes más importantes del puente incluyen las secciones de control del vuelo, la misión, la seguridad y táctica, la ingeniería, las operaciones de misiones y la ciencia.
Entre los grandes logros de ingeniería del Voyager se encuentran el sistema Warp y de dirección y el procesador de textos Bioneural Gelpack. Los pilones del motor Warp tienen la capacidad de pivotar para ajustar el campo Warp de forma eficiente a la velocidad. A la velocidad de la luz, los pilones y las góndolas Warp pivotan hacia delante. Los motores Impulse de alto rendimiento se encuentran en la unión entre el pilón y las góndolas.
Junto con los motores de maniobra, confieren al Voyager de gran agilidad. Los motores de la nave reparten la potencia por todas las instalaciones, como los deflectores de navegación, los escudos, el transportador, los sensores y la holocubierta. Cuando se enfrentaba a combates, el Voyager despliega su impresionante repertorio de armas defensivas.
La misión original del Voyager consistía en investigaciones y exploraciones, para lo que la nave está magníficamente equipada. Incluso puede aterrizar en planetas intermedios, si es necesario. A pesar de la incertidumbre de su futuro, el capitán Janeway y su tripulación siguieron desarrollando su misión en el largo camino de vuelta a casa y, en más de una ocasión, tuvieron que luchar por su vida.